Program Fast Track merupakan program percepatan studi bagi mahasiswa jenjang sarjana (S1) langsung ke jenjang magister (S2) dengan persyaratan spesifik yang ditentukan oleh program studi di Universitas Gadjah Mada, termasuk di Magister Ekonomi Pertanian. Mahasiswa dapat mempersingkat studi untuk apat menyelesaikan program sarjana dan magister sekaligus hanya dalam waktu 5 tahun.
Program ini terbuka untuk semua mahasiswa di Program Studi Sarjana Ekonomi Pertanian dan Agribisnis yang berminat melanjutkan ke Program Studi Magister Ekonomi Pertanian. Magister Ekonomi Pertanian di Fakultas Pertanian UGM berupaya memfasilitasi mahasiswa sarjana yang memiliki kemampuan akademik, motivasi studi lanjut, engagement riset dan publikasi, serta komitmen penyelesaian studi tepat waktu yang tinggi. Mahasiswa sarjana pada semester tujuh atau delapan yang sedang melaksanakan penelitian tugas akhir (skripsi) dapat mengikuti pembelajaran secara beririsan pada program magister. Sebagai upaya penjaminan keberhasilan program, mahasiswa yang mengikuti program ini diseleksi secara ketat oleh tim seleksi, dan dimonitor perkembangan studinya secara ketat. Topik riset mahasiswa harus linear antara topik skripsi sarjana dan tesis magister, dengan dosen pembimbing yang sama atau sebidang.